僵直性脊椎炎是由遗传因素和免疫系统异常引起的慢性炎症性疾病。
遗传因素是该病的主要原因之一，约90%的患者与HLA-B27基因的阳性相关。
免疫系统异常也被认为参与了该病的发生和发展过程。
患者的免疫系统对正常的脊椎韧带、滑膜组织及关节软骨产生异常反应，导致关节炎和脊椎骨质增生。
此外，感染也可能是该病的诱因之一，某些细菌感染如大肠杆菌和痢疾杆菌可能引发免疫系统异常，导致僵直性脊椎炎的发生。
尽管如此，目前对该病的具体病因仍不十分清楚，需要进一步的研究。
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