1、银行之间组成不同。农村信用社主要是有社员入股组成；而农商银行是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构。

2、银行之间性质不同。农村信用社是合作制金融机构，其性质是股份合作制；而农商银行是股份制地方金融机构。

3、银行之间管理不同。农村信用社实行的是民主化管理，就是在省联社的统一指导下，由社员自主管理、自负盈亏；而农商银行是由银行的大股东管理，采用的是现代企业管理制度，银行最大的权力机构就是股东大会。

4、银行之间监管部门不同。农商银行的监管部门是银保监会，由银行保监会批准后成立的银行；而农村信用社是由省联社监管，其实农商银行就是农村信用社的升级版。

5、银行之间规模不同。农商银行与农村信用社相比，农商银行的规模比较大，而农村信用社规模则比较小，当农村信用社规模达到一定程度的时候，就可以申请转换成农村商业银行了。

1、农商行是股份有限公司区域性金融机构，服务区域有农村和城市，服务对象有企业或个人；农村信用社是股份合作制企业的地方金融机构，主要服务对象是农民，主要服务区域是农村。

2、农商行以股东大会作为最高管理机构，农村信用社是社员民主管理。

3、农商行受银监会监管，各分行受总行直接管理；农村信用社受省联社监管，但省联社不干涉农村信用社业务，各分行独立运营，自负盈亏。

农村信用合作社，从性质上来说，它跟原来的性质差不多，它是由农民入股，由社员民主管理，主要为社员服务的合作性金融组织，其性质是股份合作制。而农村商业银行则是按照商业银行的规范来运营，属于股份制有限公司。